Справжня збірка молитовно-натхненних думок о. Іоанна складає останній його щоденник, написаний у 1907-1908 роках. Доручаючи редакцію свого щоденника, о. Іоанн назвав свій новий щоденник "Живий колос". Важко описати щиру радість Батюшки з приводу свого нового видання та його захоплення від даної їм самим назви щоденника. Ця радість ревного трудівника на ниві Божій знайде віддалену подібність у радості згорбленого працею орача, який побачив багатообіцяючий плід своєї безперервної праці. Його праця є "живий колос", тому що насіння його є "дієслова живота вічного", слово Боже; це - "живий колос", тому що кожне зернятко, з вірою взяте з цього "колоса", буде початком нового життя в Бозі. Зрозуміла чиста радість Батюшки, молитвою і сльозами трудившегося 53 року над посадкою і поливкою зерен Божих і втішеного свідомістю вічності праць своїх. . Іоанна - це атмосфера, в якій може і повинна жити душа віруючого християнина. У цьому виданні думки о. Іоанна згруповано у п'яти розділах. У першому розділі йдеться про віру і Церкву православну, про ставлення сучасних християн до віри і Церкви, про руйнівних Божу справу, серед яких перше місце посідає найлютіший ворог православ'я Толстой, і про помилки католиків. У наступних трьох розділах зображується необхідний шлях християнина від землі на небо, шлях звільнення від гріха і диявола і сходження до Бога через виконання Христових заповідей. Нарешті, в останньому розділі містяться думки, в яких Батюшка говорить про свій душевний настрій, про боротьбу з ворогом спасіння, про прагнення до Бога, хоче якнайшвидше "побачити Його, бажаного, всеблагого, прекрасного, всеблаженного, безсмертного Батька і Владику, вклонитися Йому особисто ", прославити і подякувати Богу за 79 років життя і за 53 роки священства, за скорботи і втіхи, за Боже довготерпіння і досконале прощення у покаянні, особливо за найсвятіший таїнство Тіла і Крові Христових, одним словом - "дякувати Богові за все, за все !"

Справжній щоденник складає ніби втішний духовний заповіт, залишений дорогим Батюшкою всім щиро віруючим людям, вірою в Бога і святу Церкву бажаючим врятувати свою душу. Проникливий погляд Батюшки найбільше зосереджується на поглибленні нашої свідомості у сенс падіння людини і спокутування її Божим Сином; як долучитися до Христа, а в Ньому долучитися до вічного блаженного життя - ось чому вчить о. Іоанн у своїй останній праці вчить, звичайно, за вказівками Слова Божого і святої Церкви і за власним духовним подвигом, метою якого було це блаженніше з'єднання з Христом. У подальшому дається короткий виклад цих поглядів, як воно відкривається за останніми заповідями Батюшки, що видаються тут, на що благословив нас сам о. Іоанн.