Протягом 1987–1988 років уряди СРСР та США на переговорах щодо скорочення ядерних озброєнь у Женеві уклали угоду про проведення спільних калібрувальних випробувань (підземних атомних вибухів обмеженої потужності) на ядерних полігонах Невади та Семипалатинська. Радянська розвідка отримала агентурні дані про те, що ВПК США має намір за допомогою ЦРУ зірвати домовленості, що досягнуті в Женеві. Однак у ЦК КПРС не повірили розвідінформації і більше, побоюючись розриву тендітних домовленостей із США, кремлівські куратори наказали КДБ СРСР припинити роботу розвідки у цьому напрямі. Для забезпечення безпеки САІ у КДБ СРСР створюється Координаційний Центр. У ході проведення операції контррозвідки проти встановленого агента ЦРУ, який перебуває в делегації США, слідує несподіваний провал. З метою порятунку САІ контррозвідники, минаючи вказівки ЦК, розробляють операцію «Варіант».