У новому світі, що залишився після Великої війни, змінилося все. У тіні величезного міста Залем, що висить у небі, розкинувся мегаполіс, де люди живуть серед тонн сміття, скинутого зверху. Тут процвітає злочинність, тут люди борються за існування, а біологія та техніка злилися докупи. Ласкаво просимо в Айрон сіті!Аліта прокидається у світі, який не знає, не пам'ятає, як з'явилася на світ, не пам'ятає, хто її творці. Вона – кіборг, її понівечене тіло знайшов на сміттєзвалищі доктор Дайсон Ідо. Він хоче захистити її від минулого, але за допомогою свого нового друга Х'юго вона намагається розкрити таємницю свого походження. Коли ж на неї починається полювання, Аліта з'ясовує, що має унікальні бойові здібності, які потрібні могутнім володарям Айрон сіті. І тепер Аліта має врятувати не лише своїх друзів та нову родину, а й світ, який уже став їй рідним.