Два роки минуло з того часу, як Кирито потрапив у загадковий фентезійний світ і познайомився там із Юджіо. Вони стали елітними курсантами імперської академії мечників Північної Центорії і щодня тренуються, сподіваючись стати лицарями єдності, охоронцями порядку світу людей. Ставши елітними курсантами, Кіріто і Юджіо отримали собі на службу по пажу. Кіріто дісталася Роньє, Юджіо — Тізе. Вчотирьох вони налагоджують стосунки і живуть повноцінним життям кадетів та курсантів… Але на їхньому шляху постає людська злість. Роньє та Тізе потрапляють у пастку, організовану аристократами. Дізнавшись про це, Юджіо хапається за меч, але його зупиняє віра до Церкви. Раптом його праве око пронизує сильний біль, і він бачить химерний текст священною мовою, яку він не може прочитати: «SYSTEM ALERT».