Після вибуху кривавих Війн клонів у битві на Джеонозисі обидві сторони залишаються в глухому куті, який можуть вийти лише за допомогою команд елітних воїнів, таких як загін Омега, клонів-командос із жахливими бойовими навичками та смертоносним арсеналом...

Для загону Омега, розгорнутого глибоко в тилу ворога, це та сама стара спецоперація: диверсії, шпигунство, засідки та вбивства. Але коли загін «Омега» відправляється на Корусант, найнебезпечнішу нову гарячу точку війни, коммандос виявляють, що вони не єдині, хто проникає в серце ворога.

Сплеск атак сепаратистів простежується до мережа терористичних осередків Sep у столиці республіки, керована кротом у штабі командування. Щоб виявити та знищити шпигунську та терористичну мережу сепаратистів у місті, повному цивільних, потрібні особливі таланти та навички. Навіть керівництво генералів-джедаїв разом із допомогою загону Дельта та певного сумнозвісного солдата ARC не може зрівняти шанси проти Республіканських командос. І хоча успіх може не принести перемоги у Війнах клонів, невдача означає певну поразку.